巨噬細胞是參與先天免疫反應并填充多個器官的生態(tài)位或區(qū)域的骨髓譜系細胞，作為組織發(fā)育和體內平衡的輔助細胞，并具有廣泛的免疫和非免疫相關組織支持活性。在 C57BL/6 小鼠品系中進行的譜系追蹤和命運映射研究表明，組織巨噬細胞群在整個生命中以依賴于巨噬細胞集落刺激因子和CSF1/CSF1R 信號軸的方式發(fā)育：這種發(fā)育是由卵黃囊中紅髓祖細胞 （EMP） 的瞬時造血波產生的吞噬細胞開始的， 然后是EMP來源的胎兒單核細胞根于胎兒肝臟中，最后是來自造血干細胞（HSC）的血液單核細胞譜。
已發(fā)現(xiàn)定居在不同組織中的組織駐留巨噬細胞表現(xiàn)出不同的功能和基因表達譜。例如，小膠質細胞是真正的中樞神經系統(tǒng)實質巨噬細胞，在突觸調節(jié)、突觸修剪和神經發(fā)生中起重要作用。肺泡巨噬細胞負責表面活性劑清除，這在肺泡間隙中很重要。脂肪巨噬細胞參與調節(jié)胰島素抵抗和適應性產熱，緩沖當?shù)厮璧孜锏臐舛龋鐑翰璺影贰⒅|和鐵。即使在某個組織中，巨噬細胞群體，特別是組織駐留和募集的巨噬細胞，也具有高度異質性，具有特異性標記表達，如單細胞蛋白質組或轉錄組（單細胞RNA測序，scRNA-seq），質譜細胞術和表觀遺傳學研究所揭示的那樣。這些發(fā)現(xiàn)突出了巨噬細胞的特殊可塑性以及環(huán)境生態(tài)位與巨噬細胞異質性之間的密切關系，特別是在出生后時期。循環(huán)單核細胞被證明在常駐巨噬細胞丟失后以CSF1R依賴性方式募集并占據(jù)巨噬細胞池，并且特定組織內單核細胞來源巨噬細胞之間的異質性得到充分認可。然而，尚未報道組織駐留和募集巨噬細胞之間的系統(tǒng)比較。
從機制上講，巨噬細胞細胞功能和表達譜的異質性取決于精確的轉錄調控。譜系決定轉錄因子 （LDTF），例如 PU.1 和 C/EBP，在不同組織的巨噬細胞中普遍表達。巨噬細胞的細胞類型特異性轉錄因子（TFs），如腹膜巨噬細胞中的GATA6、小膠質細胞中的SALL1和肺巨噬細胞中的PPARg，可以與LDTF協(xié)同作用以確定巨噬細胞功能。最近，一項基于466個可用小鼠RNA測序（RNA-seq）數(shù)據(jù)集的網絡聚類的大規(guī)模薈萃分析系統(tǒng)地闡明了單核吞噬細胞系統(tǒng)（MPS）細胞的轉錄圖譜，概述了巨噬細胞在轉錄水平上的TF表達譜。
組學研究提供了一種快速而系統(tǒng)的方法來確定巨噬細胞的整體異質性。來自表觀基因組學和轉錄組學研究的新證據(jù)側重于巨噬細胞異質性，這些證據(jù)普遍證明了環(huán)境影響對組織駐留巨噬細胞特化的重要性。先前對細胞類型分辨的肝臟，大腦和心臟蛋白質組的研究強調了mRNA與蛋白質分析之間的相關性差，揭示了調節(jié)蛋白質合成和降解的轉錄后過程的重要性。因此，需要對巨噬細胞蛋白質組的異質性進行分析。
蛋白質組學方法系統(tǒng)比較肝臟定居巨噬細胞Kuffer Cells和招募過來的巨噬細胞Liver Recruited Macrophages表達差異對比。基于當前認知，F(xiàn)4/80和CD11b是區(qū)分組織駐留和募集巨噬細胞的相對指標。
除了利用蛋白質組學手段研究巨噬細胞，另一個比較常見和廣泛使用的手段就體內ClodronateLiposomes清除單核巨噬細胞。ClodronateLiposomes氯膦酸二鈉脂質體是清除單核巨噬細胞的利器。相關研究頻頻見于Cell,Nature和Science。靶點科技本期文獻介紹是LIPOSOMA產品，貨號CP-005-005，該套裝包含5ml清除試劑+5ml對照試劑。ClodronateLiposomes單核巨噬細胞清除套裝近年發(fā)表于Science雜志的文獻。
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